Tools to help manipulate and analyze XPLOR energy terms

Classes
		builtins.object PY_Restraint PotData   class PY_Restraint(builtins.object)     PY_Restraint(pot, name, diff)       Methods defined here: __init__(s, pot, name, diff) Initialize self.  See help(type(self)) for accurate signature. diff(s) name(s) violated(s) Data descriptors defined here: __dict__   dictionary for instance variables (if defined) __weakref__   list of weak references to the object (if defined)   class PotData(builtins.object)     PotData(pot)       Methods defined here: __init__(s, pot) Initialize self.  See help(type(self)) for accurate signature. Data descriptors defined here: __dict__   dictionary for instance variables (if defined) __weakref__   list of weak references to the object (if defined)

Functions
		addRestraintsMethod(term) add a restraints() method analyze(potList) perform analysis of XplorPot terms and return nicely formatted summary.   Note on VDW (nonbonded) violations:   The analysis here does not heed any XPLOR constraints interaction   statements: all nonbonded violations are always reported. calcPotData(term) return PotData values for the given XPLOR term getHBDBbonds() Return info from the XPLOR HBDB energy term on each backbone H-bond in a list of named tuples. The tuples have entries:   resid_CO, resid_HN, dir_type, lin_type, dist_OH, ang_COH, ang_CaCO, ang_OHN   Edir,  Elin restraints_meth(pot)

Data
		defaultThresholds = {'ANGL': 2, 'BOND': 0.05, 'CARB': 1.0, 'CDIH': 5, 'COUP': 1.0, 'DIHE': 10, 'HBDA': 0.0, 'IMPR': 2, 'NOE': 0.5, 'VDW': 0.2, ...}