Helper functions for creating and analyzing tagPairPot.TagPairPot energy
terms.

Functions
		analyze(potlist) Perform analysis of TagPairPot terms. correlation(term) create_TagPairPot(instanceName, restraints=[], verbose=True, nonTagSel=None, paraAtomRadius=None, probWidth=None, distanceSigmoidWidth=None, varyWeights=False, minFrac=0.1, **kwargs) Create a tagPairPot.tagPairPot energy term using the specified restraints. The restraints argument should be a list of 3-element sequences. The first two specify the atom selections of the two tags, while the third specifies a P(r), either as a filename or as a string containing the P(r); in either case the file contents or string should contain lines in which the first two columns r and P(r), respectively.      nonTagSel            - selection for atoms which should be considered                          in the computation of tag weight due to overlap.                         If not specified, it is set to the tagTool                         database value (or                         tagPairDistTools.nonTagSelDefault fallback.   paraAtomRadius:      - radius of paramagnateic tag atom. If specified,                           this value overrides that specified in the                           tagCoord file. If neither is specified, it is set                          to 3 angstroms.   distanceSigmoidWidth - parameter used to compute distance-based weight                          based on tag atom distance to atoms in nonTagSel.                          If specified, this value overrides that specified                          in the tagCoord file. If neither is specified, it                          is set to 3 angstroms.   probWidth            - width of the distance distribution contribution                          from a single pair of rotamers. If specified, this                          value overrides that specified in the tagCoord                           file. If neither is specified, it is set to                          0.7 angstroms.   The created TagSimulation instance is held in the tagSimulation member.   The follow optional arguments are handled by tagPairDistTools.createTags, and documented there:     numRotamers   resname   tagCoordFilename   paraAtomname   outSegidPref   The verbose argument can be a boolean, or an integer, where larger value  results in more verbose output. plotRestraints(pot, outFilename='tagPairRestraints') Observed is green, calculated is red

Data
		dbDir = '/home/schwitrs/xplor/databases/tags' environ = environ({'ARCH': 'Linux_x86_64', 'MWWM': 'allwm'...ib/Linux_x86_64::/usr/local/lib:/usr/local/lib'})