Functions for creating and analyzing the Lee-Ping pairwise interaction term
pairLPPot.PairLPPot.

Functions
		analyze(potList) perform analysis of PairLPPot terms and return nicely formatted  summary. create_PairLPPot(name, selection='not PSEUDO', moveTol=0.5, rOn=15, rOff=17, selPairs=[], verbose=False) Return an instance of pairLPPot.PairLPPot.   rOn and rOff specify cutoff distances.   The selection argument specifies which atoms are included in the nonbonded calculation.  moveTol specifies the maximum atom displacement before the nonbonded list is recalculated.  The selPairs argument is an optional sequence of pairs of atom selection strings which specify particular pairs of atoms to compute interactions between.  The actual selections used will be the intersections of the selection argument and each selection pair entry. initTerm(term, scale=1, moveTol=0.5, interactingAtoms=None) A helper routine for resetting a PairLPPot terms to default values. FIX: rationalize default values vs. None Additionally, a simple selection pair can be specified by specifying a single atom selection string as the interactingAtoms argument. If the interactingAtoms argument is omitted, the selection pairs will be reset to those specified in create_PairLPPot.

Data
		pairParams = {'YCG YCA': (4.4, 0.1, 11), 'YCG YN2': (4.3, 0.1, 11), 'YCG YN6': (4.5, 0.05, 12), 'YCG YO2': (4.4, 0.1, 11), 'YCG YO6': (4.4, 0.1, 11), 'YCU YCA': (5.1, 0.1, 11), 'YCU YCG': (5.2, 0.01, 14), 'YCU YN2': (5, 0.1, 10), 'YCU YN6': (5.2, 0.1, 10), 'YCU YO2': (4.4, 0.01, 16), ...} params = {'YCA': (4.1, 0.56, 12), 'YCG': (5, 0.1, 10), 'YCU': (5, 0.1, 10), 'YN2': (4.9, 0.84, 10), 'YN6': (3.7, 0.56, 12), 'YO2': (4.5, 0.42, 10), 'YO6': (3.7, 0.56, 10), 'YP': (10, 0.01, 10), 'YS': (10, 0.01, 10)}